У моего сайта много доменов. Можно ли установить на все один счетчик, или для каждого нужны отдельные счетчики?

Все зависит от того, как вы хотите просматривать статистику.

Если вам нужна отдельная статистика по каждому домену/поддомену, то лучше создавать отдельный счетчик для каждого из них. При этом вы можете собирать общую статистику по ним при помощи отчета по группе счетчиков. Важно: в таких отчетах недоступны данные по целям, данные Вебвизора и Карт.

Если отдельная статистика не требуется, можно создать один счетчик на все домены/поддомены, но с учетом дополнительных настроек. В счетчике Яндекс.Метрики необходимо указать эти домены, а в счетчике Google Аналитики – настроить междоменное отслеживание. Отдельную статистику по каждому домену/поддомену в общем счетчике можно будет просматривать с помощью сегментации.